MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 7491

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_013205	TCGG	2	8	1615018	1615025	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4502	NC_013205	GAG	2	6	1615211	1615216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_013205	CGC	2	6	1615263	1615268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4504	NC_013205	TTC	2	6	1615280	1615285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4505	NC_013205	TGC	2	6	1615287	1615292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4506	NC_013205	ACG	2	6	1615350	1615355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4507	NC_013205	CCG	2	6	1615361	1615366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4508	NC_013205	TC	3	6	1615372	1615377	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4509	NC_013205	GCC	2	6	1615414	1615419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4510	NC_013205	TCC	2	6	1615455	1615460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4511	NC_013205	CTG	2	6	1615462	1615467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4512	NC_013205	GCT	2	6	1615528	1615533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4513	NC_013205	CTT	2	6	1615543	1615548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4514	NC_013205	GAT	2	6	1615574	1615579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_013205	CCA	2	6	1615585	1615590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4516	NC_013205	TGCG	2	8	1615700	1615707	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4517	NC_013205	CAC	2	6	1615715	1615720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4518	NC_013205	ATC	2	6	1615780	1615785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4519	NC_013205	ATC	2	6	1615803	1615808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4520	NC_013205	GAATC	2	10	1617936	1617945	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4521	NC_013205	T	7	7	1617972	1617978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_013205	ACGC	2	8	1618004	1618011	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4523	NC_013205	CTCG	2	8	1618067	1618074	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4524	NC_013205	GCC	2	6	1618157	1618162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4525	NC_013205	GGAAG	2	10	1618412	1618421	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_013205	TG	3	6	1618506	1618511	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_013205	TCCG	2	8	1618521	1618528	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4528	NC_013205	A	6	6	1618608	1618613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_013205	CCT	2	6	1618691	1618696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4530	NC_013205	TAG	2	6	1618718	1618723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_013205	CTT	2	6	1618737	1618742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4532	NC_013205	GAC	2	6	1618754	1618759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4533	NC_013205	ACC	2	6	1618769	1618774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4534	NC_013205	CCAA	2	8	1618791	1618798	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4535	NC_013205	CTC	2	6	1618878	1618883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4536	NC_013205	CTG	2	6	1618893	1618898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4537	NC_013205	CTT	2	6	1619059	1619064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4538	NC_013205	TTC	2	6	1619113	1619118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4539	NC_013205	C	6	6	1619138	1619143	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4540	NC_013205	AGC	2	6	1619145	1619150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4541	NC_013205	TGG	2	6	1619188	1619193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_013205	TGC	2	6	1619251	1619256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4543	NC_013205	ATG	2	6	1619284	1619289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_013205	AGA	2	6	1619324	1619329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_013205	GAATT	2	10	1619403	1619412	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_013205	TCT	2	6	1619427	1619432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4547	NC_013205	ACG	2	6	1620883	1620888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4548	NC_013205	GGC	2	6	1620942	1620947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4549	NC_013205	CA	3	6	1620997	1621002	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4550	NC_013205	ATGA	2	8	1625091	1625098	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_013205	GGA	2	6	1625105	1625110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_013205	CGG	2	6	1626623	1626628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4553	NC_013205	CGG	2	6	1629371	1629376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4554	NC_013205	CCA	2	6	1629392	1629397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4555	NC_013205	GC	3	6	1629423	1629428	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4556	NC_013205	CT	3	6	1631061	1631066	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4557	NC_013205	GC	3	6	1635940	1635945	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4558	NC_013205	AGGG	2	8	1635980	1635987	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_013205	GC	3	6	1635988	1635993	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4560	NC_013205	GAGG	2	8	1636391	1636398	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_013205	TC	3	6	1638795	1638800	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4562	NC_013205	ACA	2	6	1638832	1638837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4563	NC_013205	GCG	2	6	1638847	1638852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4564	NC_013205	GA	3	6	1638872	1638877	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_013205	TTTC	2	8	1638901	1638908	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4566	NC_013205	AGG	2	6	1638970	1638975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_013205	GAGAC	2	10	1641337	1641346	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4568	NC_013205	CAGG	2	8	1642785	1642792	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4569	NC_013205	TGA	2	6	1642837	1642842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_013205	AGG	2	6	1642879	1642884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_013205	CAG	2	6	1642889	1642894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4572	NC_013205	CA	3	6	1642911	1642916	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4573	NC_013205	GCG	2	6	1644381	1644386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4574	NC_013205	ACGTC	2	10	1645060	1645069	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4575	NC_013205	GGGA	2	8	1645095	1645102	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_013205	C	6	6	1645911	1645916	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4577	NC_013205	TGC	2	6	1645918	1645923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4578	NC_013205	ACA	2	6	1645967	1645972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4579	NC_013205	GC	3	6	1646008	1646013	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4580	NC_013205	AGG	2	6	1646055	1646060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_013205	ATG	2	6	1647479	1647484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_013205	CGG	2	6	1647735	1647740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4583	NC_013205	T	6	6	1647747	1647752	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_013205	CGC	2	6	1647771	1647776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4585	NC_013205	GAA	2	6	1647836	1647841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_013205	CGA	2	6	1649793	1649798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4587	NC_013205	GGAG	2	8	1649864	1649871	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_013205	CAC	2	6	1650514	1650519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4589	NC_013205	TCT	2	6	1651582	1651587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4590	NC_013205	GC	3	6	1651621	1651626	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4591	NC_013205	GGA	2	6	1651661	1651666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_013205	CG	3	6	1652285	1652290	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4593	NC_013205	AGG	2	6	1652818	1652823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_013205	CCT	2	6	1654347	1654352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4595	NC_013205	CCT	2	6	1655146	1655151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4596	NC_013205	GTG	2	6	1655165	1655170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_013205	AATG	2	8	1655817	1655824	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_013205	TCAT	2	8	1655830	1655837	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4599	NC_013205	T	7	7	1655891	1655897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_013205	ACG	2	6	1660570	1660575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4601	NC_013205	ACG	2	6	1660579	1660584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4602	NC_013205	GAAGG	2	10	1663607	1663616	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_013205	TGGA	2	8	1663623	1663630	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_013205	AGG	2	6	1665296	1665301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_013205	GAA	2	6	1665739	1665744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_013205	T	6	6	1665811	1665816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_013205	GA	3	6	1665817	1665822	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_013205	ATGTG	2	10	1665873	1665882	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_013205	CGC	2	6	1665900	1665905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4610	NC_013205	GCG	2	6	1665906	1665911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4611	NC_013205	CGG	2	6	1665970	1665975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4612	NC_013205	GAAGC	2	10	1666043	1666052	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4613	NC_013205	CGG	2	6	1666106	1666111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4614	NC_013205	CCG	2	6	1666148	1666153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4615	NC_013205	T	6	6	1666186	1666191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_013205	GCC	2	6	1669703	1669708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4617	NC_013205	GGC	2	6	1669713	1669718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4618	NC_013205	CCG	2	6	1669729	1669734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4619	NC_013205	TCC	2	6	1669785	1669790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4620	NC_013205	CGC	2	6	1669798	1669803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4621	NC_013205	T	6	6	1669810	1669815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_013205	GAC	2	6	1669845	1669850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4623	NC_013205	GAG	2	6	1669894	1669899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_013205	GA	3	6	1674084	1674089	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4625	NC_013205	AGGG	2	8	1674154	1674161	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_013205	GGGA	2	8	1675192	1675199	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_013205	ATA	2	6	1676251	1676256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_013205	GAAA	2	8	1676285	1676292	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_013205	TCCT	2	8	1677206	1677213	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4630	NC_013205	AGATC	2	10	1677240	1677249	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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4632	NC_013205	CATCT	2	10	1678860	1678869	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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